Pffff
Pues la has liado bien!!!...por lo que dices la única solución que se me ocurre es que acuchilles el suelo entero,la cera se habrá metido bien adentro,pero cuanto más tiempo pase más difícil será dejarlo bien...y más adentro se meterá la cera...aún estás a tiempo de recuperarlo,llama a un profesional y que te acuchillen el suelo lo suficiente para dejarlo uniforme,y después que te lo barnizen con un buen barniz especial para suelos,así lo verás brillante como lo querías ver...siento no poder darte una solución barata y/ó sencilla,pero es que no la hay,ó al menos yo no la sé.Un saludo.